長江流域涉及多個領域、多個部門、多個地方。長期以來統(tǒng)分結(jié)合、整體聯(lián)動的工作機制尚不健全，管理體制條塊分割、部門分割、多頭管理依然存在。因此，法律如何確定長江保護的管理體制至為關鍵。
　　究竟應當如何構(gòu)建長江保護的管理體制？12月27日，十三屆全國人大常委會第十五次會議舉行分組會議審議長江保護法草案時，這一問題引發(fā)部分與會人員討論。有委員建議從國家層面成立長江流域管理委員會，確立國家層面的總河長。
　　對于管理體制，草案規(guī)定：建立長江流域統(tǒng)籌協(xié)調(diào)機制下的分部門管理體制，西寧水土保持，長江流域協(xié)調(diào)機制由國務院建立。國務院長江流域協(xié)調(diào)機制負責統(tǒng)籌協(xié)調(diào)、指導、監(jiān)督長江保護工作；統(tǒng)籌協(xié)調(diào)、協(xié)商國務院有關部門及長江流域省級人民政府之間的管理工作等。
　　委員周洪宇認為，上述規(guī)定中的協(xié)調(diào)機制，職責不是太明晰，“一般來說協(xié)調(diào)機制是制度、機制，但是從現(xiàn)在條款的表述看又像協(xié)調(diào)機構(gòu)，究竟是制度、機制還是機構(gòu)？它們之間是什么關系？我覺得還需要明確。頂層設計怎么設計？提出的概念怎么明晰，需要進一步說清楚”。
　　委員韓梅也表示，上述條款對長江流域協(xié)調(diào)機制的具體機構(gòu)的設置、主要職責等沒有相應的規(guī)定，“建議補充相關內(nèi)容。同時，要強化流域聯(lián)防聯(lián)控協(xié)作機制，建議‘建立跨省區(qū)聯(lián)席會議制度，加強跨省市水體監(jiān)測網(wǎng)絡建設’，以增強流域環(huán)境保護合力為主線，建立統(tǒng)一規(guī)劃、協(xié)調(diào)、監(jiān)測、監(jiān)管和防治的聯(lián)防聯(lián)控機制，統(tǒng)籌推進污染防治、生態(tài)保護和資源管理”。
　　“我覺得中間有一個斷檔，落地不踏實”，委員竇樹華也表示，“協(xié)調(diào)機制畢竟不是一個機構(gòu)，它是一個決策機制，應該有一個專門的機構(gòu)來落實協(xié)調(diào)機制的決策部署。當然這個機構(gòu)不一定是新成立的機構(gòu)，可以把協(xié)調(diào)機制的任務落實到具體的部門。建議下一步國務院在建立這個機制的時候要明確具體的辦事機構(gòu)和工作程序，保證長江流域協(xié)調(diào)機制真正地落地”。
　　“這個統(tǒng)籌協(xié)調(diào)機制在具體建立順暢權威的運行機制方面還有所不足，需要再細化具體設計，防止各部門在齊抓共管中出現(xiàn)部門間的推諉、監(jiān)管缺失”，委員王教成也建議，進一步明確長江流域統(tǒng)籌協(xié)調(diào)機制的運作模式、管理監(jiān)督方式和職責、權限。
　　關于管理體制，草案還與河長制相銜接，提出長江流域市、縣級河長，負責落實長江流域協(xié)調(diào)機制決定的相關工作任務。
　　委員馬志武說，草案明確了城市、縣級“河長”，對基層壓實了責任，“但是我認為要從國家層面成立長江流域管理委員會，要確立國家層面的總河長，這樣才能從上往下一層壓實一層的責任，長江流域規(guī)劃的實施、時序的安排、政策的落實等，需要統(tǒng)一步調(diào)，統(tǒng)一推進。正因為長江保護是個系統(tǒng)工程，就有必要在國家層面上成立一個流域管理委員會，要有長江的總河長，當然也同時擔任長江流域管理委員會的主任，要有這種機構(gòu)來領導長江流域多省區(qū)實行共同的保護”。(記者 王姝)